Идея создания музея возникала ещё в 1930-е гг. на страницах университетской многотиражной газеты и в книге отзывов выставки по истории университета, которая была организована в 1939 г. Выставка проходила в Петровском зале, единственном сохранившемся интерьере XVIII века в здании Двенадцати коллегий. В книге отзывов выставки многократно звучало предложение преобразовать ее в постоянный музей.
