Сетевую программу Квантового университета составят образовательные дисциплины МГУ имени М.В. Ломоносова «Расчет, дизайн и методы изготовления оптических компонентов для квантовых вычислительных систем» и «Линейно-оптические квантовые вычисления», НИЯУ МИФИ – «Практическая спектроскопия» и «Лазерное охлаждение квантовых частиц», Физтеха - «Сверхпроводимость: волновая и квантовая физика джозефсоновских переходов и сверхпроводниковых кубитов на их основе», НИТУ МИСИС – «Сверпроводящие цепи и кубиты», Бауманки - «Технологии многокомпонентной элементной базы квантовой обработки информации».