Что почитать у Артема Исаева? Мы собрали несколько публикаций, которые хорошо показывают основные направления работы
Артема Исаева, героя нашего нового интервью, и его коллег — от молекулярных механизмов бактериального иммунитета до метагеномики и фаговой терапии.
🧬
Как BREX распознаёт чужую ДНКУченые определили структуру ключевого белка BREX BrxX в комплексе с ДНК и показали, как система распознаёт чужой генетический материал. Работа также помогает понять, как бактериальная защита может быть обманута фаговым белком Ocr.
✂️
Как бактериальная система PARIS разрезает тРНКСистема PARIS защищает бактерии от вирусов, запуская разрушение клеточных РНК. В этой работе подробно разобран механизм действия нуклеазы AriB и её специфичность к тРНК.
🛡
Как бактерии могут выключать CRISPR-CasИсследователи провели поиск anti-CRISPR-белков и обнаружили
AcrIE9 — ингибитор CRISPR-Cas типа IE у
E. coli K-12. Белок взаимодействует с компонентом Cascade и мешает комплексу связываться с ДНК. Важно: это препринт, который на момент публикации не прошёл рецензирование.
🧫
Новая система рестрикции-модификации у BacillusАвторы охарактеризовали новую систему
BlihIA у
Bacillus licheniformis, определили её сайт распознавания и показали, что белок ArdB способен подавлять её активность.
🧪
Как удешевить метагеномные исследованияМетагеномика начинается с довольно прозаической проблемы — выделения ДНК. Авторы сравнили восемь коммерческих наборов для разных типов образцов и показали, какие из более доступных вариантов могут конкурировать с референсными наборами.
🦠
Как фаг BF23 обходит бактериальную защитуБактерии защищаются от фагов, но и сами вирусы не остаются безоружными. В этой работе исследователи разобрали, как фаг BF23, близкий родственник T5, избегает бактериальных систем рестрикции и модификации.
🔬
Как рекомбинация плазмид нарушает защиту EcoKIИсследователи показали, что появление определённых плазмид может запускать у бактерии механизм ослабления системы рестрикции EcoKI. Получается своеобразный конфликт между мобильными генетическими элементами и собственной защитой клетки.
🧬
Что скрывается внутри терапевтического фагового коктейля?Из коммерческого фагового препарата исследователи выделили новый литический фаг
Sxt1 — родственник T3 с более широким спектром хозяев. Работа показывает, почему даже хорошо знакомые терапевтические коктейли могут содержать ещё не изученные вирусы.
Больше о работе Артема Исаева, его лаборатории и о том, как исследуют защитные системы бактерий, — в нашем новом интервью.Проект «Биология в России: люди и открытия» реализуется Биомолекулой при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках инициативы «Десятилетие науки и технологий». Партнером проекта выступила компания BioinnLabs.#Биомолекула_БиологияВРоссии