🧬Как структура белка связана с его функцией
Один из практикумов Мультишколы SBB–PlantGen 2026 посвятили структурной биологии и компьютерному моделированию белков. Занятие провёл Артур Вензель, инженер-исследователь ИЦиГ СО РАН.
Артур работает в секторе постгеномной нейробиологии и занимается исследованием того, как структура и состояние белков связаны с клеточными процессами: изучает влияние мутаций, взаимодействие белков с лигандами и посттрансляционные модификации.
В частности, одно из его последних исследований было посвящено регуляции апоптоза — например, влиянию фосфорилирования каспаз на этот процесс. AlphaFold как инструмент позволяет быстро получать 3D-модели белков.
Для чего это нужно?
На практикуме участники сами попробовали работать с вычислительными инструментами, которые позволяют получать структурную информацию о белках и использовать её уже в своих исследованиях!
Один из практикумов Мультишколы SBB–PlantGen 2026 посвятили структурной биологии и компьютерному моделированию белков. Занятие провёл Артур Вензель, инженер-исследователь ИЦиГ СО РАН.
«Все белки играют огромную роль, и их функции зависят от их структуры. На практике мы будем предсказывать структуру белков с помощью AlphaFold, а затем смотреть, как мутации могут на неё влиять».
Артур работает в секторе постгеномной нейробиологии и занимается исследованием того, как структура и состояние белков связаны с клеточными процессами: изучает влияние мутаций, взаимодействие белков с лигандами и посттрансляционные модификации.
В частности, одно из его последних исследований было посвящено регуляции апоптоза — например, влиянию фосфорилирования каспаз на этот процесс. AlphaFold как инструмент позволяет быстро получать 3D-модели белков.
Для чего это нужно?
Каспазы — главные внутриклеточные ферменты-«ножницы», расщепляющие другие белки и участвующие в апоптозе. Они содержат аминокислоту цистеин в активном центре и расщепляют белки после остатка аспарагиновой кислоты. Их петли в структуре могут влиять на доступность активного центра. Фосфат на петле может работать как своего рода «замок». AlphaFold даёт 3D-карту, которая позволяет увидеть, где расположена петля и как может изменяться пространственная организация белка.
На практикуме участники сами попробовали работать с вычислительными инструментами, которые позволяют получать структурную информацию о белках и использовать её уже в своих исследованиях!