Специалистами ФГБУ «ЦСП» ФМБА России разработана программа для ЭВМ panDPT, предназначенная для автоматизированного дизайна мультиплексных панелей вырожденных праймеров. Получено свидетельство о государственной регистрации № 2026681904 от 17.07.2026.
Программа использует инкрементальный подход для идентификации консервативных геномных регионов, введения вырожденных оснований и выбора пар праймеров. Алгоритм максимизирует покрытие целевых последовательностей, сохраняя термодинамическую совместимость и минимизируя избыточность. В применении к анализу разнообразия вирома выбранные праймеры попадают в пределы минимумов геномной энтропии, обеспечивая почти полное покрытие для новых видов вирусов. Разработка позволяет обнаруживать неизвестные подрода более чем в 90% случаев испытаний и идентифицировать новые рода в целевом семействе вирусов в 60% случаев.
panDPT позволяет осуществлять быструю разработку универсальных панелей праймеров, подходящих для целевого секвенирования нового поколения. Программное решение имеет широкий спектр применения в исследованиях вирома, включая изучение новых и малоизученных вирусов.
Разработка специалистов ФГБУ «ЦСП» ФМБА России способствует развитию методов молекулярной диагностики и эпидемиологического надзора.
См. также:
www.cspfmba.ru/institut/3...
#новостиЦСП #патентыЦСП #молекулярнаядиагностика #генетика
Программа использует инкрементальный подход для идентификации консервативных геномных регионов, введения вырожденных оснований и выбора пар праймеров. Алгоритм максимизирует покрытие целевых последовательностей, сохраняя термодинамическую совместимость и минимизируя избыточность. В применении к анализу разнообразия вирома выбранные праймеры попадают в пределы минимумов геномной энтропии, обеспечивая почти полное покрытие для новых видов вирусов. Разработка позволяет обнаруживать неизвестные подрода более чем в 90% случаев испытаний и идентифицировать новые рода в целевом семействе вирусов в 60% случаев.
panDPT позволяет осуществлять быструю разработку универсальных панелей праймеров, подходящих для целевого секвенирования нового поколения. Программное решение имеет широкий спектр применения в исследованиях вирома, включая изучение новых и малоизученных вирусов.
Разработка специалистов ФГБУ «ЦСП» ФМБА России способствует развитию методов молекулярной диагностики и эпидемиологического надзора.
См. также:
www.cspfmba.ru/institut/3...
#новостиЦСП #патентыЦСП #молекулярнаядиагностика #генетика